由于短程分子蒸餾器一般情況下是用來處理高沸點的物料產品，通常情況下粘度都是比較高的，又是用在導熱油加熱上，因此分離能力比較小，根據物料的不同品種，分離能力在一個規定的范圍內。

       設備利用液相中輕重組份分子逸出液相主體時的分子自由程差來進行的分離，實現分子蒸餾的基本條件為，輕組份分子逸出的分子自由程等于加熱面和冷凝面的實際距離，這樣正確地達到內置冷凝器實現的捕集成效，重組份分子逸出的分子自由程需要小于加熱面與冷凝面的標準距離，使它不會達到內置冷凝器，內置冷凝器捕集輕組份的分子，實現輕重組份的分離。

       設備根據分子蒸餾的原理而設計出來，為模擬分子蒸餾的模型，因加熱面與冷卻面的距離比較近，阻力相當小。鑒于內置冷凝器的作用，從而把汽化的汽相瞬時液化，實現收縮體積，因此能夠維持設備里面的高真空。

       短程分子蒸餾器的操作的真空可達絕壓，為其它蒸發、蒸餾設備所無法達到的，它很適用在常壓下的高沸點，用普通分離方法不能分離的物料，作為一種液分離設備在很多行業得到了成功的經驗。

       雖說不是復雜得設備，但是也要按照相應得順序進行操作，否則受影響得不但是蒸餾成效，設備本身也有可能因此受損得。在使用之前，要先將蒸餾器得里面洗刷一遍，以達到規定得清潔程度。

       同時還要將設備得存水替換成新的，主要是為了減少水垢得產生，但是要注意不能使短程分子蒸餾器得表面鍍層受損，否則會影響蒸餾反應得成效。然后對設備得檢查一遍，包括電源、線路、水路等，加水至規定得范圍之后可以通電使用了。